龚继昌十岁开始习武，身材粗壮，性格剽悍，好打抱不平。青年时，他为一家生计，捉过泥鳅，砍过柴卖，干过杂活。后在妻子的鼓励下凭自己的一身力气去桂林挑盐卖，每次能挑一百七八十斤，常往返于湘桂间。他每次挑盐过县城巫水时，总要在渡口杨卓镐开的粑粑店里饱吃一餐，可惜次次赊账。但杨卓镐见他为人老实，不但不计较还充钱给他作买卖头本，此后，两人遂成莫逆之交。有一次他从桂林挑盐回到城步县城，恰遇涨大水，无法过河，他对杨老板说：“若有出头之日，一定要在这里修座大桥，以解来往行人渡河之苦。”
清咸丰二年（1852年），龚继昌在广西投奔清军楚勇将领刘长佑，为镇压李秀成的太平军，先后转战于湖北、江西、安徽等省。后随曾国藩的湘军席保田部转战江西、湖南、云南、贵州数省，因在贵州金溪、崇仁等地立下卓著战功，被提升为游击加参将衔，并在城步一、二、四都招兵百余人入其部。同治三年（1864年），龚继昌在贵州生擒太平天国领袖洪秀全之子洪福?，翌年被赏换花翎加提督衔，且全家均受诰封。
同治六年（1867年），贵州咸同起义苗军攻打会同，守将龚继昌领兵迎击，苗军败走。此后，他又在贵州施洞等处执行清廷“擒渠扫穴犁庭”政策，大肆镇压苗民起义军，劫掠银两无数。同治十年（1871年）冬，他在贞丰杀害苗军首领岩大五。次年，在乌鸦坡之战擒获苗民起义领袖张秀眉、杨大六，咸同起义的苗军尽被其剿灭。咸同起义苗军被其镇压后，龚继昌被清廷加授贵州镇远府总镇，赏云骑蔚世袭。授湖北郧阳总兵后，湖南巡抚上奏将其留下统带西路防营兼长胜水师，驻守辰沅，同治十三年（1874年），赴郧阳任助修堤工。
龚继昌从贵州带兵回家时，沿途逢山开路，遇水架桥，所筑绥宁关峡、茶江一带经枫木界至城步西岩的青石通道至今犹存。光绪元年（1875年），龚继昌为践行其诺言，不惜万金，委吕赞臣督修了城步县城南端的巫水河石墩风雨桥，并将其取名“荣昌桥”。
光绪十五年（1889年），又捐资修建城步文庙（即孔圣庙），以播儒家风气。同年，城步大饥，他从辰沅运米到县内赈灾，生人给棉衣，死者给棺材。但也在同一年，龚继昌因与一官僚争夺妻妾而埋下祸根，后被对方告为贪官，于光绪十五年冬被清廷处斩，终年58岁。
